STUDI IN SILICO SENYAWA QUERCETIN TERHADAP RESEPTOR PLpro, 3CLpro dan NSP3 SEBAGAI KANDIDAT ANTIVIRUS SARS-CoV-2

Fajrin Kurniapuspa Aryanti, Ika and Susilo, Jatmiko (2021) STUDI IN SILICO SENYAWA QUERCETIN TERHADAP RESEPTOR PLpro, 3CLpro dan NSP3 SEBAGAI KANDIDAT ANTIVIRUS SARS-CoV-2. S1 thesis, Universitas Ngudi Waluyo.

	Text HALAMAN JUDUL_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (110kB)
	Text HAL PENGESAHAN_ARTIKEL - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (21kB)
	Text ABSTRAK_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (225kB)
	Text LAMPIRAN DEPAN_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (830kB)
	Text ARTIKEL_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.docx Restricted to Registered users only Download (307kB) | Request a copy
	Text ARTIKEL_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (281kB) | Request a copy
	Text BAB I_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (176kB)
	Text BAB II_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (168kB) | Request a copy
	Text BAB III_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (244kB)
	Text BAB IV_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (778kB) | Request a copy
	Text BAB V_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Download (86kB)
	Text DAFTAR PUSTAKA_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (188kB) | Request a copy
	Text LAMPIRAN BELAKANNG_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy
	Text FULL TEXT_SKRIPSI_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.docx Restricted to Registered users only Download (3MB) | Request a copy
	Text FULL TEXT_SKRIPSI_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Latar Belakang : Pandemi Covid-19 yang terjadi saat ini dapat diklasifikasikan sebagai kondisi kedaruratan atau bencana global dan menyebabkan angka kematian tinggi. Senyawa Quercetin diduga dapat digunakan sebagai antivirus, dengan mencegah sintesis dan replikasi RNA Virus membentuk ikatan dengan protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisa potensi Quercetin sebagai inhibitor 3CLpro, PLPro, dan NSP3 pada SARS-CoV-2 melalui molecular docking. Metode : Penelitian eksperimental dilakukan dengan cara analisis in silico melalui sistem komputasi molecular docking terhadap senyawa Quercetin sebagai kandidat antivirus Covid-19 terhadap 3CLpro, PLpro dan NSP3 menggunakan software PLANTS dan YASARA. Hasil : Nilai validasi ligand native RMSD < 2.0 Å pada ketiga protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan dihasilkan skor docking ligand native dan senyawa Quersetin terhadap protein pada kode PDB 5R7Y yakni (-62,25±1,52) dan (-70,359±0,31), kode PDB 3E9S yakni (-110,3349±0,48) dan (-79,1542±1,12), serta kode PDB 6WOJ yakni (-136,1779±2,03) dan (-87,3134±0,82). Hasil uji ANNOVA p <0,001 dan Uji Post Hoc p<0,001 yang menunjukkan ada perbedaan skor docking secara signifikan. Kesimpulan : Senyawa Quercetin mampu berikatan dengan asam amino pada protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan memiliki perbedaan skor docking diantara ketiganya. Namun ikatan yang lebih poten yaitu senyawa Quercetin dengan protein 3CLpro yang ditunjukkan dengan hasil rata-rata skor docking Quercetin lebih rendah dari ligand native, sehingga dapat dikatakan sebagai kandidat antivirus Covid-19. Kata Kunci : Quercetin, Inhibitor SARS-CoV-2, In Silico Kepustakaan : 39 (1988 – 2021)

Actions (login required)

View Item